Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HttP42859 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HttP42859 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HttP42859 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HttP42859 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HttP42859 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HttP42859 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HttP42859 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HttP42859 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HttP42859 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HttP42859 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HttP42859 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HttP42859 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HttP42859 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HttP42859 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HttP42859 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HttP42859 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HttP42859 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HttP42859 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HttP42859 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HttP42859 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HttP42859 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HttP42859 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HttP42859 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HttP42859 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HttP42859 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HttP42859 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HttP42859 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HttP42859 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HttP42859 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HttP42859 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HttP42859 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HttP42859 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HttP42859 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HttP42859 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HttP42859 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HttP42859 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HttP42859 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HttP42859 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HttP42859 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HttP42859 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HttP42859 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HttP42859 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HttP42859 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HttP42859 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HttP42859 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HttP42859 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HttP42859 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HttP42859 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HttP42859 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HttP42859 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HttP42859 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HttP42859 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HttP42859 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HttP42859 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HttP42859 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HttP42859 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HttP42859 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HttP42859 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HttP42859 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HttP42859 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HttP42859 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HttP42859 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HttP42859 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HttP42859 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HttP42859 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HttP42859 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HttP42859 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HttP42859 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HttP42859 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HttP42859 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HttP42859 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HttP42859 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HttP42859 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HttP42859 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HttP42859 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HttP42859 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HttP42859 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HttP42859 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HttP42859 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HttP42859 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HttP42859 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HttP42859 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HttP42859 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HttP42859 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HttP42859 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HttP42859 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HttP42859 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HttP42859 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HttP42859 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HttP42859 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HttP42859 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 616.8 ms