Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ercc5P35689 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ercc5P35689 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ercc5P35689 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ercc5P35689 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ercc5P35689 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms