Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin1P35438 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin1P35438 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin1P35438 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin1P35438 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Grin1P35438 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Grin1P35438 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Grin1P35438 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin1P35438 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Grin1P35438 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Grin1P35438 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin1P35438 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin1P35438 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin1P35438 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin1P35438 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin1P35438 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin1P35438 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Grin1P35438 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grin1P35438 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms