Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Grin2aP35436 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Grin2aP35436 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Grin2aP35436 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Grin2aP35436 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Grin2aP35436 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Grin2aP35436 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Grin2aP35436 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms