Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TpoP35419 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TpoP35419 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TpoP35419 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TpoP35419 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TpoP35419 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TpoP35419 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TpoP35419 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TpoP35419 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TpoP35419 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TpoP35419 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TpoP35419 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TpoP35419 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TpoP35419 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TpoP35419 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TpoP35419 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TpoP35419 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TpoP35419 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TpoP35419 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TpoP35419 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TpoP35419 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TpoP35419 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TpoP35419 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TpoP35419 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TpoP35419 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TpoP35419 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TpoP35419 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TpoP35419 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TpoP35419 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TpoP35419 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TpoP35419 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TpoP35419 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TpoP35419 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TpoP35419 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TpoP35419 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TpoP35419 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TpoP35419 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TpoP35419 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TpoP35419 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TpoP35419 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TpoP35419 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TpoP35419 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TpoP35419 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TpoP35419 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TpoP35419 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TpoP35419 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TpoP35419 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TpoP35419 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TpoP35419 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TpoP35419 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TpoP35419 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TpoP35419 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TpoP35419 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TpoP35419 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TpoP35419 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TpoP35419 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TpoP35419 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TpoP35419 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TpoP35419 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TpoP35419 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TpoP35419 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TpoP35419 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TpoP35419 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TpoP35419 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TpoP35419 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TpoP35419 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TpoP35419 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TpoP35419 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TpoP35419 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TpoP35419 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TpoP35419 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TpoP35419 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TpoP35419 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TpoP35419 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TpoP35419 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TpoP35419 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TpoP35419 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TpoP35419 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TpoP35419 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TpoP35419 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TpoP35419 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TpoP35419 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TpoP35419 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TpoP35419 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TpoP35419 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms