Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Apoc1P34928 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Apoc1P34928 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoc1P34928 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms