Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tfap2aP34056 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tfap2aP34056 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tfap2aP34056 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tfap2aP34056 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tfap2aP34056 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfap2aP34056 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms