Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim2P33610 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim2P33610 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim2P33610 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prim2P33610 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim2P33610 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim2P33610 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prim2P33610 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim2P33610 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prim2P33610 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim2P33610 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim2P33610 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim2P33610 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prim2P33610 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prim2P33610 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prim2P33610 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prim2P33610 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prim2P33610 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms