Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Oprk1P33534 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Oprk1P33534 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Oprk1P33534 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Oprk1P33534 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms