Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Notch4P31695 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Notch4P31695 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Notch4P31695 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Notch4P31695 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Notch4P31695 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Notch4P31695 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Notch4P31695 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Notch4P31695 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Notch4P31695 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Notch4P31695 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Notch4P31695 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Notch4P31695 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Notch4P31695 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Notch4P31695 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms