Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdgfbP31240 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfbP31240 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfbP31240 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfbP31240 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms