Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RxrbP28704 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrbP28704 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RxrbP28704 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxrbP28704 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrbP28704 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RxrbP28704 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrbP28704 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrbP28704 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxrbP28704 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RxrbP28704 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrbP28704 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RxrbP28704 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrbP28704 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RxrbP28704 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RxrbP28704 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms