Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col2a1P28481 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col2a1P28481 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col2a1P28481 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col2a1P28481 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms