Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex1P28352 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex1P28352 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apex1P28352 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apex1P28352 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apex1P28352 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apex1P28352 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apex1P28352 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apex1P28352 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apex1P28352 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apex1P28352 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apex1P28352 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apex1P28352 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apex1P28352 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apex1P28352 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apex1P28352 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apex1P28352 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apex1P28352 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apex1P28352 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apex1P28352 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apex1P28352 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apex1P28352 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apex1P28352 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apex1P28352 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apex1P28352 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apex1P28352 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apex1P28352 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apex1P28352 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apex1P28352 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apex1P28352 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apex1P28352 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apex1P28352 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms