Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa3P28310 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa3P28310 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa3P28310 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa3P28310 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa3P28310 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa3P28310 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms