Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vav1P27870 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vav1P27870 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vav1P27870 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav1P27870 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav1P27870 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vav1P27870 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav1P27870 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav1P27870 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vav1P27870 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vav1P27870 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav1P27870 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav1P27870 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav1P27870 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms