Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af2P26369 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af2P26369 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af2P26369 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af2P26369 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af2P26369 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af2P26369 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af2P26369 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af2P26369 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af2P26369 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af2P26369 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af2P26369 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af2P26369 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms