Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CftrP26361 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CftrP26361 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CftrP26361 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CftrP26361 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
CftrP26361 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CftrP26361 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CftrP26361 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CftrP26361 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CftrP26361 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CftrP26361 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CftrP26361 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CftrP26361 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CftrP26361 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
CftrP26361 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CftrP26361 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CftrP26361 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CftrP26361 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CftrP26361 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CftrP26361 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CftrP26361 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CftrP26361 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CftrP26361 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CftrP26361 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
CftrP26361 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
CftrP26361 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CftrP26361 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CftrP26361 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CftrP26361 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CftrP26361 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CftrP26361 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CftrP26361 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CftrP26361 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CftrP26361 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CftrP26361 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CftrP26361 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CftrP26361 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CftrP26361 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CftrP26361 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
CftrP26361 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CftrP26361 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
CftrP26361 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CftrP26361 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CftrP26361 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
CftrP26361 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CftrP26361 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
CftrP26361 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CftrP26361 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CftrP26361 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CftrP26361 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CftrP26361 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CftrP26361 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CftrP26361 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
CftrP26361 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CftrP26361 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CftrP26361 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CftrP26361 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CftrP26361 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
CftrP26361 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CftrP26361 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CftrP26361 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CftrP26361 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CftrP26361 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CftrP26361 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CftrP26361 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CftrP26361 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CftrP26361 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
CftrP26361 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CftrP26361 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
CftrP26361 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
CftrP26361 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CftrP26361 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CftrP26361 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CftrP26361 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CftrP26361 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CftrP26361 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CftrP26361 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CftrP26361 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CftrP26361 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CftrP26361 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CftrP26361 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CftrP26361 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CftrP26361 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CftrP26361 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CftrP26361 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CftrP26361 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CftrP26361 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CftrP26361 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CftrP26361 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CftrP26361 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CftrP26361 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CftrP26361 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CftrP26361 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CftrP26361 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CftrP26361 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CftrP26361 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CftrP26361 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CftrP26361 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CftrP26361 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CftrP26361 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms