Protein–RNA interactions for Protein: P25785

Timp2, Metalloproteinase inhibitor 2, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp2P25785 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp2P25785 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp2P25785 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp2P25785 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp2P25785 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp2P25785 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp2P25785 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp2P25785 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp2P25785 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timp2P25785 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp2P25785 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp2P25785 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp2P25785 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp2P25785 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms