Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gja1P23242 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gja1P23242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja1P23242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gja1P23242 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja1P23242 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gja1P23242 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gja1P23242 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gja1P23242 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja1P23242 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gja1P23242 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gja1P23242 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja1P23242 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja1P23242 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gja1P23242 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gja1P23242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms