Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bmp4P21275 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bmp4P21275 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bmp4P21275 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bmp4P21275 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms