Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkcaP20444 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkcaP20444 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkcaP20444 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkcaP20444 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms