Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P18533 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P18533 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P18533 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P18533 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18533 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18533 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18533 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18533 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18533 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18533 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
P18533 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P18533 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P18533 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18533 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18533 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18533 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18533 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18533 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18533 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18533 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18533 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18533 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
P18533 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P18533 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18533 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18533 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18533 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18533 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P18533 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18533 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18533 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18533 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18533 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18533 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18533 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
P18533 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P18533 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P18533 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18533 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P18533 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P18533 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P18533 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
P18533 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P18533 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P18533 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P18533 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P18533 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P18533 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18533 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18533 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P18533 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18533 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18533 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18533 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18533 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18533 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18533 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P18533 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P18533 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P18533 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P18533 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P18533 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
P18533 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P18533 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P18533 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
P18533 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P18533 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms