Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18530 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18530 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18530 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P18530 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18530 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18530 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P18530 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P18530 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18530 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18530 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18530 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18530 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P18530 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18530 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P18530 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18530 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18530 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18530 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P18530 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18530 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P18530 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P18530 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18530 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18530 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18530 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P18530 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P18530 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P18530 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P18530 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P18530 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P18530 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18530 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18530 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18530 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P18530 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18530 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18530 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18530 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18530 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18530 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P18530 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P18530 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P18530 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P18530 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P18530 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P18530 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P18530 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18530 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18530 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18530 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18530 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18530 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18530 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P18530 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P18530 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18530 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18530 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18530 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P18530 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18530 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18530 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P18530 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18530 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P18530 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18530 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18530 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18530 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18530 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P18530 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P18530 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P18530 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P18530 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P18530 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P18530 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P18530 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P18530 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P18530 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P18530 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P18530 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P18530 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms