Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tph1P17532 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tph1P17532 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tph1P17532 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tph1P17532 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tph1P17532 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tph1P17532 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tph1P17532 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tph1P17532 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tph1P17532 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tph1P17532 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tph1P17532 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tph1P17532 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tph1P17532 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms