Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kcna3P16390 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kcna3P16390 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kcna3P16390 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcna3P16390 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kcna3P16390 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kcna3P16390 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms