Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lmnb1P14733 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmnb1P14733 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmnb1P14733 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmnb1P14733 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmnb1P14733 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmnb1P14733 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms