Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Dnmt1P13864 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Dnmt1P13864 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Dnmt1P13864 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Dnmt1P13864 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Dnmt1P13864 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Dnmt1P13864 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Dnmt1P13864 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Dnmt1P13864 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Dnmt1P13864 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Dnmt1P13864 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Dnmt1P13864 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Dnmt1P13864 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Dnmt1P13864 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms