Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Tnni2P13412 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Tnni2P13412 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Tnni2P13412 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Tnni2P13412 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Tnni2P13412 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tnni2P13412 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms