Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn1P12960 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn1P12960 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn1P12960 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntn1P12960 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntn1P12960 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntn1P12960 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms