Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cxcl1P12850 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cxcl1P12850 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcl1P12850 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cxcl1P12850 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms