Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctla2bP12400 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctla2bP12400 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctla2bP12400 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctla2bP12400 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctla2bP12400 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctla2bP12400 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms