Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa1P11477 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa1P11477 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa1P11477 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa1P11477 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa1P11477 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Defa1P11477 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa1P11477 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms