Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sub1P11031 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sub1P11031 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sub1P11031 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sub1P11031 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sub1P11031 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sub1P11031 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sub1P11031 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms