Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Tnp1P10856 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Tnp1P10856 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Tnp1P10856 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms