Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PolP10400 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PolP10400 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PolP10400 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PolP10400 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP10400 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP10400 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP10400 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP10400 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP10400 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP10400 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP10400 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP10400 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP10400 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP10400 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP10400 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP10400 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP10400 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP10400 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP10400 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP10400 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolP10400 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP10400 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP10400 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolP10400 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolP10400 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP10400 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP10400 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP10400 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolP10400 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP10400 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP10400 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP10400 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolP10400 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP10400 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP10400 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP10400 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolP10400 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP10400 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms