Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3P09920 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3P09920 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3P09920 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3P09920 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Csf3P09920 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3P09920 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3P09920 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Csf3P09920 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3P09920 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csf3P09920 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms