Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ifna9P09235 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifna9P09235 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifna9P09235 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifna9P09235 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms