Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifna4P07351 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifna4P07351 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifna4P07351 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ifna4P07351 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms