Protein–RNA interactions for Protein: P06328

Ig heavy chain V region VH558 B4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06328 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06328 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06328 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06328 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06328 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06328 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06328 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06328 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06328 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06328 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06328 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06328 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06328 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06328 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06328 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06328 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06328 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06328 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06328 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06328 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06328 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06328 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06328 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06328 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06328 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06328 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06328 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06328 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06328 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06328 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06328 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06328 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06328 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06328 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06328 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06328 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06328 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06328 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06328 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06328 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06328 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P06328 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06328 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06328 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06328 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P06328 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06328 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06328 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06328 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06328 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06328 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P06328 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms