Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06323 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06323 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06323 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06323 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06323 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P06323 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06323 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06323 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06323 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06323 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06323 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06323 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06323 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06323 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06323 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06323 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06323 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06323 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06323 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06323 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06323 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06323 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P06323 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06323 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06323 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06323 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06323 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06323 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06323 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06323 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06323 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06323 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06323 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06323 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06323 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06323 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06323 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06323 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06323 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06323 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06323 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06323 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06323 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P06323 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06323 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P06323 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06323 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06323 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06323 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P06323 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06323 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06323 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06323 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06323 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06323 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P06323 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06323 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P06323 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06323 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06323 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06323 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms