Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgamP05555 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ItgamP05555 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ItgamP05555 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ItgamP05555 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgamP05555 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgamP05555 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgamP05555 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ItgamP05555 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgamP05555 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgamP05555 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgamP05555 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgamP05555 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgamP05555 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgamP05555 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgamP05555 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgamP05555 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms