Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxa7P02830 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxa7P02830 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxa7P02830 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hoxa7P02830 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms