Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt10P02535 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt10P02535 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt10P02535 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt10P02535 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt10P02535 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt10P02535 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt10P02535 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt10P02535 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt10P02535 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt10P02535 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt10P02535 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt10P02535 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms