Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tp53P02340 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53P02340 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53P02340 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tp53P02340 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53P02340 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tp53P02340 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53P02340 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tp53P02340 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms