Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16■□□□□ 0,15
P01896 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
P01896 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
P01896 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15,99■□□□□ 0,15
P01896 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P01896 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P01896 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P01896 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
P01896 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P01896 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P01896 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P01896 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,98■□□□□ 0,15
P01896 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15,98■□□□□ 0,15
P01896 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
P01896 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
P01896 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
P01896 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,97■□□□□ 0,15
P01896 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15,97■□□□□ 0,15
P01896 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
P01896 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
P01896 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15,97■□□□□ 0,15
P01896 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
P01896 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,95■□□□□ 0,14
P01896 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
P01896 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
P01896 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
P01896 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
P01896 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
P01896 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
P01896 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
P01896 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
P01896 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
P01896 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15,93■□□□□ 0,14
P01896 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
P01896 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15,93■□□□□ 0,14
P01896 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
P01896 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
P01896 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
P01896 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
P01896 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
P01896 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
P01896 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
P01896 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15,91■□□□□ 0,14
P01896 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15,91■□□□□ 0,14
P01896 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
P01896 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
P01896 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15,9■□□□□ 0,14
P01896 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
P01896 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
P01896 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15,89■□□□□ 0,13
P01896 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,89■□□□□ 0,13
P01896 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
P01896 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
P01896 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15,88■□□□□ 0,13
P01896 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
P01896 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
P01896 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56,8 ms