Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01843 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01843 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01843 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01843 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01843 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01843 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01843 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01843 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01843 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01843 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01843 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01843 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01843 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01843 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01843 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01843 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01843 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01843 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01843 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01843 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01843 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01843 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01843 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01843 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01843 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01843 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01843 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01843 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01843 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01843 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01843 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01843 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01843 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01843 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01843 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01843 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01843 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01843 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01843 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01843 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01843 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01843 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01843 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01843 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01843 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01843 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01843 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01843 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01843 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01843 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01843 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01843 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01843 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01843 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01843 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01843 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01843 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01843 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01843 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01843 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01843 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01843 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01843 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01843 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01843 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01843 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01843 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01843 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01843 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01843 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms