Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01729 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01729 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01729 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01729 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01729 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01729 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01729 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01729 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01729 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01729 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01729 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01729 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01729 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01729 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01729 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01729 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01729 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01729 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01729 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01729 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01729 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01729 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01729 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01729 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01729 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01729 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01729 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01729 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01729 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01729 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01729 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P01729 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01729 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01729 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01729 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01729 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01729 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01729 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01729 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01729 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms