Protein–RNA interactions for Protein: P00342

Ldhc, L-lactate dehydrogenase C chain, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhcP00342 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LdhcP00342 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LdhcP00342 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LdhcP00342 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhcP00342 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhcP00342 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LdhcP00342 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhcP00342 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhcP00342 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LdhcP00342 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhcP00342 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LdhcP00342 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhcP00342 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LdhcP00342 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LdhcP00342 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhcP00342 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LdhcP00342 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms