Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp1O89090 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp1O89090 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp1O89090 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sp1O89090 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp1O89090 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp1O89090 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp1O89090 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp1O89090 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sp1O89090 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp1O89090 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sp1O89090 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp1O89090 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp1O89090 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp1O89090 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sp1O89090 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sp1O89090 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sp1O89090 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms